峰型問題是液相色譜儀的主要問題，在做液相分析過程中，我們就是要變換不同的條件來改變不好的峰型，對于樣品的異常峰，要區別對待，從主要問題出發，一個一個加以解決。
1、色譜圖中未出峰 系統未進樣或樣品分解;泵未輸液或流動相使用不正確;檢測器設置不正確;針對以上情況成因作相應調整。
2、一個峰或幾個峰是負峰 流動相吸收本底高;進樣過程中進入空氣;樣品組分的吸收低于流動相。
3、出的峰均為負峰 信號電纜接反或檢測器輸出及性設置顛倒;光學裝置尚未達到平衡。
4、出的峰均為寬峰 系統未達到平衡;溶解樣品的溶劑及性比流動相差很多;色譜柱尺寸及類型選擇不正確;色譜柱或保護柱被污染或柱效低了;溫度變化造成的影響。
5、所出峰比預想的小 樣品黏度過大;進樣品故障或進樣體積誤差;檢測器設置不正確.定量環體積不正確;檢測池污染;檢測器燈出現問題。
6、出現倆峰或肩峰 進樣量過大;樣品濃度過高;保護柱或色譜柱柱頭堵塞;保護拄或色譜柱污染或失效;柱塌陷或形成短通道。
7、前伸峰：進樣量或樣品濃度高，溶解樣品的溶劑較流動相多;保護柱或色譜柱污染或失效。
①柱溫低：升高柱溫;②樣品溶劑選擇不恰當：使用流動相作為樣品溶劑;③樣品過載：減少樣品含量;④色譜柱損壞：換柱子。
8、拖尾峰：柱過載，減少樣品量;增加柱直徑采用較高容量的固定相;峰干擾，對樣品進行清潔過濾;調整流動相;硅羥基作用，加入三乙胺，用堿致鈍化柱增加緩沖液或鹽的濃度減少流動相pH值;柱內燒結不銹鋼失效，換燒結不銹鋼;加在線過濾器，對樣品進行過濾;死體積或柱外體積過大，將連接點改低;盡可能使用內徑較細的連接管;柱效下降，換柱子;采用保護柱，對柱子進行老化。
9、出現平頭峰 檢測器設置不正確;進樣體積太大或樣品濃度太高。
10、出現多峰 進樣閥殘余峰，可能為上次樣品的殘余。在每次進完樣后用時間來平衡和清洗系統;樣品中存在未知物，改進樣品的預處理;流動相污染，換流動相，盡可能現配現用，隔夜的流動相再次使用時要過濾;盡可能使用HPLC試劑;流路中有小的氣泡，打開Purge閥，加快流速。
11、峰分叉 ①保護柱或分析柱污染：取下保護柱再進行分析,如果不行換保護柱。如果分析柱阻塞,拆下來清洗。如果問題仍然存在,可能是柱子被強保留物質污染,運用適當的措施。如果問題仍然存在,入口可能被阻塞,換篩板或換色譜柱。②樣品溶劑不溶于流動相改變樣品溶劑,如果可能采取流動相作為樣品溶劑。
12、峰變形 樣品過載，減少樣品載量。
13、早出的峰變形 樣品溶劑選擇不恰當 ①減少進樣體積 ②運用低及性樣品溶劑
14、早出的峰拖尾程度大于晚出的峰 柱外效應 ①調整系統連接(使用短、內徑小的管路)
②使用小體積的流通池
15、酸性或堿性化合物的峰拖尾 緩沖不適合①使用濃度50～100 mM的緩沖液②使用等于流動相pH值的緩沖液
16、額外的峰 (1)樣品中有其他組分：正常現象;(2)、進樣的洗脫峰：①增加運行時間或梯度斜率②增加流速;(3)空位或峰：①檢查流動相是否干凈 ②使用流動相作為樣品溶劑 ③減少進樣體積。